phpのCGI版とモジュール版って　どう違うんでしょうか？

「CGI 版」より「モジュール版」のパフォーマンスが上回っている。

それはCGI版の場合、プログラムが呼び出される度にプロセスが立ち上がるんだけど、
モジュール版（Apache の拡張モジュール）で動く場合は、余計なプロセスが立ち上がらずにすむから。